История разворачивается вокруг наивной и доброй девушки Кобато, которая внезапно появляется в обычном человеческом мире с необычной миссией — исполнить самое заветное желание, которое она не может сформулировать сама. Для этого ей нужно заполнить специальную волшебную бутылочку, собирая в неё печали и горести людей, которых она помогает исцелять.
